MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978 plasmid pMETHO01

Total Repeats: 5263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019972	TAAA	2	8	364	371	75 %	25 %	0 %	0 %	435849689
2	NC_019972	TAC	2	6	479	484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849689
3	NC_019972	TTC	2	6	515	520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849689
4	NC_019972	TCT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849689
5	NC_019972	ACTGGA	2	12	543	554	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	435849689
6	NC_019972	ATG	2	6	576	581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
7	NC_019972	TTA	2	6	586	591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849689
8	NC_019972	AAT	2	6	732	737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849689
9	NC_019972	CAT	2	6	791	796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849689
10	NC_019972	TAT	2	6	797	802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849689
11	NC_019972	TGA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
12	NC_019972	GATA	2	8	812	819	50 %	25 %	25 %	0 %	435849689
13	NC_019972	ATAA	2	8	840	847	75 %	25 %	0 %	0 %	435849689
14	NC_019972	T	6	6	848	853	0 %	100 %	0 %	0 %	435849689
15	NC_019972	ATG	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
16	NC_019972	TG	3	6	887	892	0 %	50 %	50 %	0 %	435849689
17	NC_019972	A	6	6	926	931	100 %	0 %	0 %	0 %	435849689
18	NC_019972	ATG	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
19	NC_019972	TGA	2	6	1055	1060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849689
20	NC_019972	TCT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849689
21	NC_019972	GAG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849689
22	NC_019972	AG	3	6	1231	1236	50 %	0 %	50 %	0 %	435849689
23	NC_019972	TTTC	2	8	1272	1279	0 %	75 %	0 %	25 %	435849689
24	NC_019972	TTG	2	6	1284	1289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849689
25	NC_019972	TTA	2	6	1290	1295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849689
26	NC_019972	AACA	2	8	1307	1314	75 %	0 %	0 %	25 %	435849689
27	NC_019972	TTTA	2	8	1342	1349	25 %	75 %	0 %	0 %	435849689
28	NC_019972	GT	3	6	1353	1358	0 %	50 %	50 %	0 %	435849689
29	NC_019972	TGATT	2	10	1400	1409	20 %	60 %	20 %	0 %	435849689
30	NC_019972	CT	3	6	1416	1421	0 %	50 %	0 %	50 %	435849689
31	NC_019972	TGGT	2	8	1483	1490	0 %	50 %	50 %	0 %	435849689
32	NC_019972	AT	3	6	1530	1535	50 %	50 %	0 %	0 %	435849689
33	NC_019972	ATT	2	6	2623	2628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
34	NC_019972	TAA	2	6	2706	2711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849690
35	NC_019972	ACT	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849690
36	NC_019972	T	7	7	2769	2775	0 %	100 %	0 %	0 %	435849690
37	NC_019972	TGTT	2	8	2781	2788	0 %	75 %	25 %	0 %	435849690
38	NC_019972	T	6	6	2790	2795	0 %	100 %	0 %	0 %	435849690
39	NC_019972	GAT	2	6	2959	2964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849690
40	NC_019972	TGT	3	9	2979	2987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849690
41	NC_019972	AGCA	2	8	2994	3001	50 %	0 %	25 %	25 %	435849690
42	NC_019972	ATT	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
43	NC_019972	TCCAT	2	10	3191	3200	20 %	40 %	0 %	40 %	435849690
44	NC_019972	CTT	2	6	3286	3291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
45	NC_019972	GAT	3	9	3294	3302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849690
46	NC_019972	TTC	2	6	3313	3318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
47	NC_019972	TCA	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849690
48	NC_019972	AAT	2	6	3397	3402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849690
49	NC_019972	CTTG	2	8	3414	3421	0 %	50 %	25 %	25 %	435849690
50	NC_019972	TTA	2	6	3422	3427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
51	NC_019972	AT	3	6	3448	3453	50 %	50 %	0 %	0 %	435849690
52	NC_019972	CTATC	2	10	3488	3497	20 %	40 %	0 %	40 %	435849690
53	NC_019972	TTC	2	6	3515	3520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
54	NC_019972	GTT	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849690
55	NC_019972	GGA	2	6	3599	3604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849690
56	NC_019972	TGAT	2	8	3607	3614	25 %	50 %	25 %	0 %	435849690
57	NC_019972	TTAT	2	8	3640	3647	25 %	75 %	0 %	0 %	435849690
58	NC_019972	TAA	2	6	3654	3659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849690
59	NC_019972	CTT	2	6	3898	3903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
60	NC_019972	TTA	2	6	3944	3949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
61	NC_019972	TAAT	2	8	3953	3960	50 %	50 %	0 %	0 %	435849690
62	NC_019972	TTCA	2	8	3999	4006	25 %	50 %	0 %	25 %	435849690
63	NC_019972	TTC	2	6	4068	4073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
64	NC_019972	ATAG	2	8	4087	4094	50 %	25 %	25 %	0 %	435849690
65	NC_019972	TTC	2	6	4104	4109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
66	NC_019972	GA	3	6	4133	4138	50 %	0 %	50 %	0 %	435849690
67	NC_019972	TACT	2	8	4279	4286	25 %	50 %	0 %	25 %	435849690
68	NC_019972	CTG	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849690
69	NC_019972	GTA	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849690
70	NC_019972	CTT	2	6	4379	4384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
71	NC_019972	T	7	7	4432	4438	0 %	100 %	0 %	0 %	435849690
72	NC_019972	AAG	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849690
73	NC_019972	TCA	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849690
74	NC_019972	AAC	2	6	4512	4517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849690
75	NC_019972	CAT	2	6	4526	4531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849690
76	NC_019972	AG	3	6	4558	4563	50 %	0 %	50 %	0 %	435849690
77	NC_019972	GAT	2	6	4587	4592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849690
78	NC_019972	TAT	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849690
79	NC_019972	TTC	2	6	4732	4737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849690
80	NC_019972	A	6	6	4808	4813	100 %	0 %	0 %	0 %	435849690
81	NC_019972	T	6	6	4816	4821	0 %	100 %	0 %	0 %	435849690
82	NC_019972	GGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849690
83	NC_019972	AT	3	6	5043	5048	50 %	50 %	0 %	0 %	435849691
84	NC_019972	ATCAAG	2	12	5092	5103	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	435849691
85	NC_019972	GAA	2	6	5139	5144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849691
86	NC_019972	TCA	2	6	5156	5161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849691
87	NC_019972	TTC	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849691
88	NC_019972	TTAAT	2	10	5210	5219	40 %	60 %	0 %	0 %	435849692
89	NC_019972	ATA	2	6	5277	5282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849692
90	NC_019972	AAAGA	2	10	5286	5295	80 %	0 %	20 %	0 %	435849692
91	NC_019972	TGT	2	6	5363	5368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849692
92	NC_019972	GTT	2	6	5572	5577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849693
93	NC_019972	TC	3	6	5587	5592	0 %	50 %	0 %	50 %	435849693
94	NC_019972	ATT	2	6	5675	5680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849693
95	NC_019972	GAT	2	6	5719	5724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849693
96	NC_019972	CTGG	2	8	5772	5779	0 %	25 %	50 %	25 %	435849693
97	NC_019972	TTTCC	2	10	5844	5853	0 %	60 %	0 %	40 %	435849693
98	NC_019972	TGCT	2	8	5895	5902	0 %	50 %	25 %	25 %	435849693
99	NC_019972	CTT	2	6	5964	5969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849693
100	NC_019972	TTC	2	6	5981	5986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849693
101	NC_019972	TTC	2	6	5989	5994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849693
102	NC_019972	ATTG	2	8	6024	6031	25 %	50 %	25 %	0 %	435849693
103	NC_019972	T	6	6	6064	6069	0 %	100 %	0 %	0 %	435849694
104	NC_019972	GCAT	2	8	6092	6099	25 %	25 %	25 %	25 %	435849694
105	NC_019972	CT	3	6	6254	6259	0 %	50 %	0 %	50 %	435849694
106	NC_019972	CTA	2	6	6265	6270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849694
107	NC_019972	CAT	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849694
108	NC_019972	TGT	2	6	6342	6347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849694
109	NC_019972	AG	3	6	6364	6369	50 %	0 %	50 %	0 %	435849694
110	NC_019972	TTTC	2	8	6439	6446	0 %	75 %	0 %	25 %	435849694
111	NC_019972	TTG	2	6	6498	6503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849694
112	NC_019972	ACA	2	6	6540	6545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849694
113	NC_019972	CTT	2	6	6568	6573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849694
114	NC_019972	ATT	2	6	6656	6661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435849694
115	NC_019972	CTT	2	6	6662	6667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849694
116	NC_019972	T	6	6	6724	6729	0 %	100 %	0 %	0 %	435849694
117	NC_019972	T	7	7	6767	6773	0 %	100 %	0 %	0 %	435849694
118	NC_019972	CATA	2	8	6796	6803	50 %	25 %	0 %	25 %	435849694
119	NC_019972	TCA	2	6	6831	6836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849694
120	NC_019972	T	8	8	7059	7066	0 %	100 %	0 %	0 %	435849695
121	NC_019972	AAG	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849695
122	NC_019972	TCT	2	6	7173	7178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849695
123	NC_019972	TCC	2	6	7184	7189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849695
124	NC_019972	TGAA	2	8	7258	7265	50 %	25 %	25 %	0 %	435849695
125	NC_019972	TGA	2	6	7308	7313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849695
126	NC_019972	TTTCG	2	10	7330	7339	0 %	60 %	20 %	20 %	435849695
127	NC_019972	TCTTT	2	10	7367	7376	0 %	80 %	0 %	20 %	435849695
128	NC_019972	A	6	6	7524	7529	100 %	0 %	0 %	0 %	435849696
129	NC_019972	ATC	2	6	7540	7545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849696
130	NC_019972	CCA	2	6	7589	7594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849696
131	NC_019972	AAG	2	6	7623	7628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849696
132	NC_019972	TGA	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849696
133	NC_019972	GA	3	6	7679	7684	50 %	0 %	50 %	0 %	435849696
134	NC_019972	TTC	2	6	7763	7768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849696
135	NC_019972	TTC	2	6	7856	7861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849696
136	NC_019972	TGA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849696
137	NC_019972	CAG	2	6	7884	7889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849696
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142	NC_019972	CAT	2	6	8171	8176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849697
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264	NC_019972	T	6	6	19649	19654	0 %	100 %	0 %	0 %	435849707
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